メダカチャンネル 7(科学・学習)
NEW「少年よ、メダカの研究はすごいぞ!」今回の内容は難しいが解読せよ。
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メダカゲノム(全遺伝情報)の解読/日本生まれの実験動物から脊椎動物進化の道筋

  発表者: 情報・システム研究機構国立遺伝学研究所 小原 雄治所長
       東京大学大学院理学系研究科生物科学専攻 武田 洋幸教授
       東京大学大学院新領域創成科学研究科  森下 真一教授

 国立遺伝学研究所と東京大学の共同プロジェクトでメダカのゲノム(全遺伝情報)
解読に成功。この成果は、6月7日発行の英国科学誌Nature(ネイチャー)誌に掲
載される予定。本研究では約7億の塩基配列を決定し、その中に20,141個の遺伝子
を見つけた。メダカゲノムはヒトゲノムの4分の1の大きさで、ヒト遺伝子組成と非
常によく似ている。ヒトの遺伝病に関連するメダカの遺伝子も数多く見つかった。
今回のメダカゲノム解読により基礎生命科学が飛躍的に発展するものと期待される。
メダカのゲノム解読は完成度が極めて高く、全染色体の約90%が解明された。
 メダカは稲作文化と密接に関連していて日本をはじめとする東アジアに生息。
日本には性質に違いのある地域集団が存在していてその一つの南日本由来系統のゲ
ノム解読を行い北日本由来系統とDNA塩基配列を比較したところ、約1600万個の
違い(1塩基多型(SNP))が見つかる。DNA塩基全体の3.4%をも占めることを解明。
この率は、今まで知られている脊椎動物種の中では最も高いものである。
これら北と南日本由来のメダカは交配可能。ある生殖や性決定に関連する遺伝子群
の進化速度が緩やかということが判明し、それが交配可能に関連していると考えら
れる。メダカは個別の生物種として分かれる前段階の遺伝的変化を研究するための
貴重な材料として今後期待される。
メダカはダツ目に属し、遺伝的にはサンマ、トビウオ、サヨリの仲間と近い関係
にあり、海の魚が淡水に適応したと考えられている。メダカは江戸時代より飼育され
ていて、その江戸時代の図鑑には野生型メダカ、ヒメダカ、シロメダカなども記載。
1999年、環境庁(現環境省)がメダカを絶滅危惧種に指定し社会的に脚光を浴びた。
メダカの実験動物としての歴史は古く、日本人の研究者による数々の研究がある。
日本発の実験動物であるメダカは、欧米で開発され世界中で用いられているゼブラフ
ィッシュを相補う特性を持つことから、それに勝るとも劣らない優れた実験動物とし
て注目を集めている。実験動物として一層の発展のために、ゲノムの解読は不可欠。
2002年に開始されたメダカゲノムプロジェクトで、脊椎動物のゲノムを丸ごと高精
度に解読した例は国内では皆無で世界的にも稀だったがこの難しいプロジェクトを可
能にした仕組みが、文部科学省科学研究費特定領域研究である。特定領域研究「ゲノ
ム」(2000-2004年度)では生物学、医学、コンピュータ科学、理工学、など広い
分野から研究者が集まって共同研究を推進。独自の手法の開発また、ゲノム配列解析
など集中的に引き受けるグループをつくり、効率化を図り異分野融合と基盤作りへの
体制によってメダカゲノム解読につながった。
メダカゲノムは魚類の中では完成度の極めて高いゲノムとなったことから、脊椎動物
のゲノムが進化してきた過程を調べることが可能となって、さらに時間をかけて進化
解析をおこない、それらの成果を合わせて今回発表された。
 さらに詳しくは:東京大学理学系研究科プレスリリース 2007.6.7発表

「ノックアウトメダカって!」2007.2.15
 皆さん、ノックアウトメダカと聞いてどんなメダカを想像しますか?
まず単純に連想したのは「ボクシング」のシーンでした。いくらなんでもメダ
カにボクシング用語ってことはありえないし(笑)。実は、この聞き慣れない
「ノックアウトメダカ」というのは科学分野の専門用語でありました。
以下2.15付朝日新聞の記事より:
『特定の遺伝子を働かなくし、病気の原因究明や新薬開発に役立てる実験用
のメダカ「ノックアウトメダカ」づくりに京都大大学院医学研究科の武田俊一
教授らのグループが成功し、英科学誌「ゲノム・バイオロジー」に発表した。
実用化されているのはマウスしかおらず、日本発の新しい実験動物として注目
される。』
*なるほど難しい研究が行われているわけで、人類の病気治療等に役立つ研究
にメダカを使うと、これまでより安価に複雑な実験ができるということです。

「NHKふしぎワールドでメダカワールド!」2006.6.13

メダカの授業が始まる季節です。この度NHK教育「理科5年ふしぎワールド」
のホームページ教材のリンクコーナーにメダカワールドがリンクされました。
 今回のテーマは「動物のたんじょう」です。
放送は6月14日(水)10:00・15日(木)10:15
   6月21日(水)10:00・22日(木)10:15
メダカの誕生も勉強できます、さらに詳しく知りたいならNHKデジタル教材  

「2006年国際大百科からメダカキッズへGO!」

 2006年公開予定のブリタニカ・ジャパン「ブリタニカ国際大百科事典」
にて、メダカサイト内のメダカキッズがリンクされることとなりました。
毎年春になると全国の小学校でメダカの学習の時にインターネットでメダカ
キッズをたくさんの小学生に見ていただいておりますが今後さらに、ブリタ
ニカ国際大百科事典からもリンクされることとなり、喜ばしい反面、責任の
重さも感じております。より充実したサイトを目指しますので、今後もよろ
しくお願い申し上げます。2005.11メダカサイト・メダカワールド・キッズ

*CD- ROM・LAN・オンライン版の百科事典項目「メダカ」

「2006年春、生き物からの癒しを科学せよ!」  2005.10.23

 いよいよ来春学生募集の特集が新聞等に掲載される季節となりました。
そこでメダカチャンネル注目の大学・学科は、東京農業大学が4月に開設
するバイオセラピー学科、環境学生の育成。以下学科紹介文の抜粋/
「生き物からの癒しを科学する。」
●バイオセラピーは、脱モノ・心の時代、総環境時代が求めるテーマ
●生き物文化、人と動物とのかかわりへの文明的問いかけ
●心身の健康維持・増進に動物や植物を活用、等 情報:東京農業大学案内より

*20世紀「そ〜とのぞいて見てごらん」の時代から、
 21世紀は「ふか〜くのぞいて見てごらん」の時代に。メダカワールド

追記:東京農大の農学科分野にある昆虫生態学研究室では(大学HP掲載)
「身近な里地・里山の生物を調査研究し、それらとの共生をはかる」という
テーマで日本における農業生態系を研究している。以下紹介文
『メダカがいなくなった、カエルの鳴き声が聞けないという話を耳にするよう
に、急速に多くの生物が姿を消している。今、この身近な環境で、何が起こっ
ているのだろうか。まず、里地・里山を中心に、われわれが深く関わってきた
環境について現状を把握する調査を行っている。そして、生物を衰退させた要
因をつきとめるとともに、その保全や復活を考えビオトープを設営して実験観
察などを行っている。』
*「環境学生」東京農業大学登録商標(学科紹介の為使わせていただきました)

「メダカ稚魚のスケルトンな研究」 情報提供:愛媛のshihoさん 2004.6.1

*2004年、メダカ稚魚のスケルトンな研究の日々。
「 私が使っている餌は朱色なのですが、メダカの赤ちゃんって、スケルトンな
ボディなので餌を食べたらおなかが赤くなってるように見えます。餌やりの楽
しみが増えました。「よしよし、いっぱい食べたねぇ。」と見てわかるんです。
 am10:50エサやり 11:00なぜか左側 11:10真ん中へ 12:30ひろがった
    
 色が抜ける瞬間まで観察できませんでしたが、翌朝は灰色になっていました。
 それは内臓の色なのか?はたまたウ○チの色なのか?、、続く。
--:なるほど、メダカの稚魚をよ〜く見てみると透けています。
食べたエサが、子メダカの体内を通過していく様子がわかりますね〜。あまりに
も小さなスケルトンボディなのでかなり目を近付けて観察したと思われます。
これからも意外な発見を期待してま〜す。

*スケルトンなお話し
1998年頃、斬新なデザインをしたパソコンが登場!
それはアップル社の「iマック」というスケルトンボディのパソコン。
今まで、コンピューター(パソコン)に興味を示さなかった人達にもカワイイ
と大ブレーク。その影響で巷ではスケルトンブームが到来!。いろんな品々に
スケルトンが採用され販売されてたのでした。
      iマック

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